Fragen und Antworten
Wozu kann der MALDI-UP-Katalog verwendet werden?
Im MALDI-UP-Katalog sind Probenmaterialien, MALDI-Einzelspektren und Datenbankeinträge gelistet. Dabei werden jedoch nicht die Spektren bzw. Datenbankeinträge selbst, sondern die Metadaten der Messungen und Probenmaterialien in Form einer Übersichtliste dargestellt. Die Messdateien verbleiben bei den Erstellenden des Eintrags und werden nicht auf MALDI-UP hochgeladen.
Bei Interesse an einem konkreten Material, Einzelspektrum oder Datenbankeintrag kann über die Kontaktdaten der Erstellenden kontaktiert und für einen Austausch von Spektren angefragt werden. Das Ziel des MALDI-UP-Kataloges ist es, durch den gegenseitigen Austausch von Informationen zwischen MALDI-Nutzern eine Netzwerkbildung zu unterstützen und die Anwendungsmöglichkeiten für die Nutzer zu erweitern.
Ist die Nutzung von MALDI-UP kostenfrei?
Ja. MALDI-UP soll den freien wissenschaftlichen Austausch zwischen Nutzern erleichtern. Das im MALDI-UP gelistete Tausch-Angebot soll keinen kommerziellen Charakter haben. Eine Anleitung zur Nutzung der MALDI-UP-Liste befindet sich auf der Website als „User Guide“ unter dem Reiter Catalogue.
Wer betreibt MALDI-UP?
MALDI-UP wurde als gemeinsame Initiative von MALDI-Nutzern aus den Untersuchungsämtern Baden-Württembergs und des Landesbetriebs Hessisches Landeslabor im Jahr 2015 gestartet. Die Webseite wird als Subdomain von ua-bw.de unter den dort genannten Bedingungen gehostet. Die Pflege und Redaktion übernehmen zurzeit Mitarbeitende des Chemischen und Veterinäruntersuchungsamtes Stuttgart (CVUAS).
Ist MALDI-UP auf Mikroorganismen wie Bakterien beschränkt?
Nein. Mikroorganismen stellen aufgrund der bisherigen Interessen der Nutzer zwar einen großen Anteil der Referenz- und Validierungsspektren. Die Plattform ist aber ausdrücklich für eine große Vielfalt an Applikationen offen.
Neben Mikroorganismen finden sich Referenzspektren u. a. zu Fleisch, Fisch, Milchprodukten, Insekten, Krebstieren, Pilzen und Pflanzen. Diese finden z. B. Anwendung zur Tierartenidentifizierung. Weitere Themen sind willkommen.
Wie recherchiere ich im MALDI-UP Katalog?
Es gibt verschiedene Datenblätter im MALDI-UP-Katalog (Excel-Datei), in welchen die verfügbaren Informationen gegliedert sind:
- Isolates - Materials: Daten zu den verwendeten Probenmaterialien (Isolate sowie tierische und pflanzliche Materialien), z. B. Genus, Spezies, Verifikation der Benennung etc.
- Database Entries: Daten zu Messungen von Datenbankeinträgen (MSPs), z. B. Probenvorbereitung, Matrix, Zahl verwendeter Spektren etc.
- Single Spectra: Daten zu Messungen von Einzelspektren, z. B. Probenvorbereitung, Matrix, Messdatum
Diese Tabellen können jeweils mithilfe der Filterfunktion schrittweise eingegrenzt werden, sodass nach bestimmten Themengebiete recherchiert werden kann. Hilfreich ist auch die Suchfunktion mittels der Tastenkombination [STRG] und [F]. In den weiteren Datenblättern finden Sie Informationen zu Kontaktdaten, Literaturstellen und der Historie des MALDI-UP-Katalogs.
Wie frage ich Messdateien von Einzelspektren oder Datenbankeinträgen an?
In den Tabellen der Einzelspektren und Datenbankeinträge ist die für die jeweilige Zeile verantwortliche Institution in der Spalte „user responsible for the row / Verantwortlich für die Zeile“ genannt. Die Mailadressen der Ansprechpartner finden sich im Reiter „Contact“.
Tipp: Setzen Sie bei Ihrer Anfrage ‚MALDI-UP‘ als Stichwort mit in die Betreffzeile Ihrer Mail.
Welche Informationen finde ich im Datenblatt „Isolates - Materials“?
In dem Datenblatt „Isolates - Materials“ sind die zu allen im Katalog gelisteten Isolaten oder Probenmaterialien gehörenden Metadaten möglichst einheitlich zusammengestellt.
Unter der Spalte „isolate / material owner / example of public collection“ // „Isolat Besitzer“ ist angegeben, wo eigene Materialien zu Vergleichszwecken angefragt werden können. Für Bakterienisolate aus öffentlichen Sammlungen wird eine beispielhafte Bezugsquelle genannt.
Gibt es auch Spektren, die direkt heruntergeladen werden können?
Einige Spektren sind frei im Internet verfügbar und können bei den angegebenen Quellen zu den dort angegebenen Bedingungen heruntergeladen werden. Im MALDI-UP-Katalog wird in den Tabellenblättern „Database Entries“ und „Single Spectra“ die Verfügbarkeit der Spektren in den Spalten A bis E angegeben. Durch Einstellung des Filters lassen sich die „Free download“ Spektren anzeigen. Die Referenzen sind als Nummer angegeben und finden sich mit einem Link im Reiter „Literature“.
Darüber hinaus existieren frei verfügbare MALDI-Spektren-Datenbanken. Links zu einigen dieser Datenbanken sind hier auf der MALDI-UP-Webseite unter dem Reiter Tools – Abschnitt „MALDI-Databases“ – zu finden.
Kann ich Feedback zu einzelnen Spektren oder Datenbankeinträgen geben?
Sie haben mit einem oder mehreren Einzelspektren/ Datenbankeinträgen gute Erfahrungen gemacht oder Sie haben Anmerkungen/Kritik und möchten diese rückmelden? Senden Sie hierfür eine formlose Mail an unter Nennung des jeweiligen Einzelspektrums oder Datenbankeintrags. Wir nehmen die Rückmeldungen anonymisiert in den MALDI-UP-Katalog auf.
Ihr Tauschpartner freut sich sicherlich auch über eine Info via CC in der Mail.
Kann ich selbst Spektren beitragen?
Ja. Ein neuer Datenbankeintrag oder ein Validierungs-Einzelspektrum kann dem Katalog (in Microsoft Excel) in dem vorgegebenen Format hinzugefügt werden. Hierfür können Sie das Formular „New Entries for MALDI-UP" einsetzen.
Als neuer Nutzer hinterlegen Sie zudem wenige personenbezogene Daten, die Sie als Besitzer der Spektren kennzeichnen. Das Formular versenden Sie bitte an
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Ist ein anderer Nutzer an Ihren Spektren oder Datenbankeinträgen interessiert, kann über diese Besitzerdaten ein Kontakt hergestellt und die Spektren können bei Ihnen angefragt werden.
Es findet eine redaktionelle Prüfung Ihrer Metadaten statt. Anschließend werden die neuen Einträge mit dem nächsten Update des Katalogs veröffentlicht.
In welchen Zeitabständen wird die MALDI-UP-Liste aktualisiert?
Üblicherweise aktualisieren wir den MALDI-UP-Katalog mindestens alle 4 Wochen. Bei großen Änderungen, beispielsweise bei von einer großen Zahl Neueinträgen, werden auch Zwischenupdates durchgeführt.
Wie kann ich eine Veranstaltung mit Themenbezug zu MALDI listen lassen?
Wir pflegen auf der MALDI-UP-Seite einen Bereich für Veranstaltungen/ Events. Die Listung ist kostenlos. Kommerzielle Angebote und Angebote von Unternehmen werden als solche gekennzeichnet. Wenden Sie sich gerne an . Die Veröffentlichung auf der MALDI-UP-Website erfolgt anschließend vorbehaltlich der redaktionellen Entscheidung.