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Catalogue MALDI-UP – Le libre échange entre utilisateurs

La spectrométrie de masse de type MALDI-TOF (ionisation laser assistée par une matrice et analyseur à temps de vol; MALDI-TOF MS) est une technologie reconnue, dont les applications pour l'identification des espèces ne cessent de se diversifier. L’élément central pour garantir des résultats fiables est l’existence d’une base de données robuste, composée de spectres protéiques de référence.

Le catalogue MALDI-UP facilite l’échange de spectres MALDI-TOF MS entre utilisateurs travaillant en microbiologie, en analyse alimentaire et dans d’autres disciplines.

Objectifs et avantages:

  • Mise à disposition de bases de données de haute qualité, directement exploitables en laboratoire
  • Échange mutuel de données (par ex. spectres protéiques)
  • Promotion de la création d’un réseau international d’utilisateurs MALDI
  • Extension des possibilités d’application de la plateforme
  • Réduction des lacunes diagnostiques, en particulier dans le domaine de la microbiologie

Les actualités relatives aux mises à jour de la base de données sont consultables via notre journal de bord.
Des réponses aux questions les plus fréquentes sont disponibles dans la FAQ, et vous pouvez également nous contacter directement
.

Le catalogue MALDI-UP

Le MALDI-TOF-MS offre un large éventail d’applications pour l’identification d’espèces, notamment:

  • des isolats bactériens issus de la microbiologie alimentaire
  • des isolats bactériens provenant du diagnostic vétérinaireI
  • des échantillons alimentaire d’origine animale
  • des échantillons alimentaire d’origine végétale

L’identification d’un organisme inconnu repose sur la comparaison entre le spectre protéique obtenu et les spectres de référence présents dans la base de données.

En complément des bases de données commerciales existantes, il est possible d’y intégrer ses propres entrées. Les applications peuvent ainsi être enrichies par vos ressources ou élargies à de nouveaux domaines encore inexplorés.

C’est précisément la mission du catalogue MALDI-UP: fournir, au format Excel, des informations sur les spectres MALDI-TOF MS collectés auprès de différents utilisateurs. Le catalogue contient des détails sur les spectres individuels, les entrées de référence, ainsi que sur les isolats et matériaux correspondants. Grâce à une recherche ciblée, les utilisateurs peuvent identifier des personnes de contact dans leur domaine et leur adresser des demandes spécifiques concernant les spectres.

Le concept MALDI-UP a été conçu et développé par l’Institut d’analyse chimique et vétérinaire de Stuttgart (CVUA Stuttgart) et le Laboratoire d’État de Hesse.

Sources

Rau J (2021); MALDI-TOF Massenspektrometrie – Die Nutzerplattform MALDI-UP (Journal); Lebensmittelchemie 75(3) 74–76 [GERMAN]

Rau J, Männig A, Hiller E, Mauder N, Wind C, Horlacher S, Kadlec K, Schwarz S, Contzen M (2016); MALDI-TOF mass spectrometry for reliable identification of bacteria – A validation based on Staphylococcaceae field isolates (Journal); Aspects of food control and animal health 2016 03 1–46

Rau J, Hiller E, Männig A, Dyk M, Wenninger O, Stoll P, Wibbelt G, Schreiter P (2021); Animal species identification of meat using MALDI-TOF mass spectrometry (Journal); Aspects of Food Control and Animal Health 14 1–12