Veranstaltungen – Events

24.–26.11.2020: Neuer Termin – Ausgebucht! MALDI-TOF MS – Eigene Datenbanken mit Validierung für die Artbestimmung von Tieren, Pilzen und Mikroorganismen; Schulung mit Praxis, CVUA Stuttgart

Werkzeuge – Tools

Form "New Entries for MALDI-UP"

MicrobeMS: A Matlab Toolbox for Analysis of Microbial MALDI-TOF Mass Spectra.

Prokaryotic Nomenclature Up-to-date, Search database, Leibniz Institute DSMZ, German Collection of Microorganisms and Cell Cultures.

Spectra: Extended spectra database for microorganism identification by MALDI-TOF MS – Public Health Agency of Sweden.

Referenzen/Verweise – References/Links

2020

Alssahen M, Hassan AA, Rau J, Sammra O, Wickhorst J-P, Lämmler C, Prenger-Berninghoff E, Eisenberg T, Abdulmawjood A (2020); Comparative studies on Schaalia (Actinomyces) hyovaginalis isolated from wild boar, goat and sheep. Berliner und Münchner Tierärztliche Wochenschrift 158, 3222.

Alssahen M, Hassan AA, Sammra O, Lämmler C, Saarnisto MR, Borowiak M, Malorny B, Rau J, Prenger-Beringhoff E, Plötz M, Abdulmawjood A (2020); Epidemiological analysis of arcanobacterium phocae isolated from cases of mink dermatitis of a single farm. Veterinary Microbiology 243: 108618.

Alssahen M, Peters M, Rau J, Hassan AA, Sammra O, Lämmler C, Prenger-Beringhoff E, Plötz M, Abdulmawjood A (2020); Phenotypic and genotypic approach to characterize a Trueperella pyogenes strain isolated from an Eurasian lynx (Lynx lynx). Berliner und Münchner Tierärztliche Wochenschrift 158, 3216.

Dangel A, Berger A, Rau J, Eisenberg T, Kämpfer P, Margos G, Contzen M, Busse HJ, Konrad R, Peters M, Sting R, Sing A (2020); Corynebacterium silvaticum sp. nov., a unique group of NTTB corynebacteria in wild boar and roe deer. Int J Syst Evol Microbiol 2020, 004195.

Eisenberg T, Heydel C, Prenger-Bernighoff E, Fawza A, Kling U, Akimkin V, Semmler T, Mühldorfer K, Kämpfer P, Blom J, Ewers C (2020);Streptobacillus canis sp. nov. isolated from a dog. Int J Syst Evol Microbiol, 70: 2648–2656.

Eisenberg, T., S. P. Glaeser, H.-P. Hamann, J. Blom, P. Kämpfer (2018); Genus Devriesea. - In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2020.

Palmer R, Fleming GTA, Gläser S, Semmler T, Flamm A, Ewers C, Kämpfer P, Budich O, Berrow S, O’Brien J, Siebert U, Evelyn C, Ruttledge M, Eisenberg T (2020); Marine mammals are natural hosts of Oceanivirga salmonicida, a bacterial pathogen of Atlantic salmon. Diseases of Aquatic Organisms 139, 161–174.

Rahi P, Vaishampayan P (2020); Editorial: MALDI-TOF MS Application in Microbial Ecology Studies; Frontiers in Microbiology 10:2954. doi: 10.3389/fmicb.2019.02954.

Rau J, Korte N, Dyk M, Wenninger O, Schreiter P, Hiller E (2020); Rapid animal species identification of feta and mozzarella cheese using MALDI-TOF mass-spectrometry. Food Control, 107349.

Volokhov DV, Blom J, Amselle M, Delmonte P, Gao Y, Shen Z, Zhang S, F. Gulland M, Chizhikov VE, Eisenberg T (2020); Oceanivirga miroungae sp. nov. isolated from oral cavity of northern elephant seal (Mirounga angustirostris); Int J Syst Evol Microbiol, in press.

2019

Becker R, Rau J, Fuchs J, Wind C, Stoyke M (2019); Compound database in official food control – Thoughts and challenges for validation and verification; Eurachem, 20.–24.05.2019 Tartu; Poster.

Berger A, Dangel A, Peters M, Mühldorfer K, Braune S, Eisenberg T, Szentiks CA, Rau J, Konrad R, Hörmansdorfer S, Ackermann N, Sing A (2019); Tox-positive Corynebacterium ulcerans in hedgehogs, Germany. Emerging Microbes & Infections, 8: 211–217.

Brändle K, Wind C (2019); Bodenseefelchen in der amtlichen Lebensmitteluntersuchung – Im Fokus: Massenspektrometrische Untersuchung von Blaufelchen und Gangfisch. Rundschau für Fleischhygiene und Lebensmittelüberwachung 71: 95–96.

Fuchs J, Rullmann A, Wind C (2019); Identifizierung von Thunfischarten mittels Sequenzierung und MALDI-TOF MS. Amtstierärztlicher Dienst und Lebensmittelkontrolle, Sonderausgabe zur 60. Arbeitstagung des Arbeitsgebietes Lebensmittelsicherheit und Verbraucherschutz der DVG: 24.09.2019.–27.9.2019, Seite 217. Poster.

Mühldorfer K, Rau J, Fawzy A, Heydel C, Glaeser SP, van der Linden M, Kutzer P, Knauf-Witzens T, Hanczaruk M, Eckert AS, Eisenberg T (2019); Streptococcus castoreus, an uncommon group A Streptococcus in beavers; Antonie van Leeuwenhoek (2019).

Nesseler A, Schauterle N, Geiger C, Kaerger K, Walther G, Kurzai O, Eisenberg T (2019); Sporothrix humicola (Ascomycota: Ophiostomatales) – A soil-borne fungus with pathogenic potential in the eastern quoll (Dasyurus viverrinus) Medical Mycology Case Reports 25:39–44.

Rau J, Eisenberg T, Peters M, Berger A, Kutzer P, Lassnig H, Hotzel H, Sing A, Sting R, Contzen M (2019); Reliable differentiation of a non-toxigenic tox gene-bearing Corynebacterium ulcerans variant frequently isolated from game animals using MALDI-TOF MS. Veterinary Microbology 237, 108399.

Rau J, Schreiter P, Eisenberg T, Hiller E (2019); MALDI-UP – Die MALDI-TOF MS User Plattform zum freien Austausch von Spektren. 38. DVG-AVID Bakteriologie, 11.–13.09.2019, Bad Staffelstein; Poster.

Sabrowski A, Bachert A, Müller-Hohe E, Fuchs J, Wind C (2019); Identifikation von Krebstieren mittels MALDI-TOF-MS. Amtstierärztlicher Dienst und Lebensmittelkontrolle, Sonderausgabe zur 60. Arbeitstagung des Arbeitsgebietes Lebensmittelsicherheit und Verbraucherschutz der DVG: 24.09.2019.–27.9.2019, Seite 233. Poster.

Sting R, Eisenberg T, Hrubenja M (2019); Rapid and reasonable molecular identification of bacteria and fungi in microbiological diagnostics using rapid real-time PCR and Sanger sequencing. Journal of Microbiological Methods, 159: 148–156.

Wind C, Müller-Hohe E, Fuchs J, Becker E, Bohl B (2019); Fischrogen: Artidentifizierung mittels MALDI-TOF-MS. Amtstierärztlicher Dienst und Lebensmittelkontrolle, Sonderausgabe zur 60. Arbeitstagung des Arbeitsgebietes Lebensmittelsicherheit und Verbraucherschutz der DVG: 24.09.2019–27.9.2019, Seite 237. Poster.

2018

Eisenberg T (2018): Phylogenetische Untersuchungen und vergleichende Genomanalysen innerhalb der Familie Leptotrichiaceae unter besonderer Berücksichtigung von Streptobacillus moniliformis, dem Erreger des Rattenbissfiebers. - Laufersweiler (Gießen), Habilitationsschrift am Fachbereich Veterinärmedizin der Justus-Liebig-Universität, 508 S. (ISBN 978-3-8359-6667-3).

Eisenberg T, Glaeser SP, Blom J, Kämpfer P (2018); Genus Caviibacter. In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2018: 1–7.

Eisenberg T, Glaeser SP, Blom J, Kämpfer P (2018); Genus Leptotrichia. In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2018: 1–4.

Eisenberg T, Glaeser SP, Blom J, Kämpfer P (2018); Genus Oceanivirga. - In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2018: 1–7.

Eisenberg T, Glaeser SP, Blom J, Kämpfer P (2018); Genus Sebaldella. In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2018: 1–4.

Eisenberg T, Glaeser SP, Blom J, Kämpfer P (2018); Genus Sneathia. In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2018: 1–7.

Eisenberg T, Glaeser SP, Blom J, Rau J, Kämpfer P (2018); Genus Streptobacillus. In: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, in association with Bergey's Manual Trust. Digital Edition 2018: 1–7.

Lasch P, Stämmler M, Schneider A (2018); Version 3 (20181130) of the MALDI-TOF Mass Spectrometry Database for Identification and Classification of Highly Pathogenic Microorganisms from the Robert Koch-Institute (RKI) [Data set]; Zenodo.

Lasch P, Wahab T, Weil S, Pályi B, Tomaso H, Zange S, Grranerud BK, Drevinek M, Kokotovic B, Wittwer M, Pflüger V, Di Caro A, Stämmler M, Grunow R, Jacob D (2018); Identification of highly pathogenic microorganisms using MALDI-TOF Mass Spectrometry: Results of an interlaboratory ring trial; Journal of Clinical Microbiology 53: 2632–40.

Michel V, Ulber C, Pöhle D, Köpke B, Engel K, Kaim U, Fawzy A, Funk S, Fornefett J, Baums CG, Eisenberg T (2018); Clinical infection in house rats (Rattus rattus) caused by Streptobacillus notomytis. Antonie van Leeuwenhoek 111: 1955–1966.

Rau J, Schreiter P, Eisenberg T, Hiller E (2018); MALDI-UP – the MALDI-TOF MS User Platform – Exchange of spectra to support diagnostics; 16. Medical Biodefense Conference, 28.–31.10.2018, Munich; Poster.

Sammra O, Rau J, Wickhorst J, Alssahen M, Hassan AA, Lämmler C, Prenger-Berninghoff E, Abdulmawjood A (2018); Further characteristics of Arcanobacterium pinnipediorum DSM 28752T and Arcanobacterium wilhelmae DSM 102162T, two novel species of genus Arcanobacterium; Folia Microbiol 63: 695–700.

Stalb S, Hiller E, Rau J, Eisenberg T, Sting R (2018); Pathological significance of Helcococcus ovis and Helcococcus kunzii in veterinary medicine. Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift 131: 482–488.

2017

Fuchs J, Krause A, Skuballa J, Eisenbeiss F, Pietsch K, Wind C (2017); Fischarten-Identifizierung mittels MALDI-TOF MS. Amtstierärztlicher Dienst und Lebensmittelkontrolle, Sonderausgabe: 26.9.–29.9.2017, Seite 149.

Hiller E, Männig A, Rau J (2017); Tierartendifferenzierung bei Fleisch – Mit MALDI-TOF-MS von der Datenbank zur Validierung. Deutsche Lebensmittelrundschau 113: 12–16.

Männig, A, Hiller E., Rau J (2017); MALDI-TOF MS zur Tierartenbestimmung bei Milch und Käse. 46; Deutscher Lebensmittelchemikertag 25.–27.09.2017, Würzburg; Poster.

Mueller-Hohe E, Scherer B, Schill S, Wind C (2017); Listeria monocytogenes in einem Räucherfischbetrieb MALDI-TOF-MS als neues “Source-Tracking-Tool”. 58. Arbeitstagung des Arbeitsgebietes Lebensmittelhygiene der DVG, 26.-29.09.2017, Garmisch-Partenkirchen; Poster.

Wind C (2017); MALDI-TOF-MS-Subtyping zur Differenzierung von Mikroorganismen-Stämmen. Amtstierärztlicher Dienst und Lebensmittelkontrolle, Sonderausgabe: 26.9.–29.9.2017, ISSN 0945-3296, Seite 96.

2016

Eisenberg T, Ewers C, Rau J, Akimkin V, Nicklas W (2016); Approved and novel strategies in diagnostics of rat bite fever and other Streptobacillus infections in humans and animals. Virulence, 7:6, 630–648.

Nardy E, Contzen M, Rau J (2016); Aeromonas oder Deefgea? Sichere Identifizierung durch MALDI-TOF MS und FT-IR. 16. EAFP-Gemeinschaftstagung der Deutschen, Österreichischen und Schweizer Sektion vom 05.–07.10.2016, Graz; Internetbeitrag zum Poster.

Rahi P, Prakash O and Shouche YS (2016); Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass-Spectrometry (MALDI-TOF MS) Based Microbial Identifications: Challenges and Scopes for Microbial Ecologists; Frontiers in Microbiology 7:1359.

Rau J, Eisenberg T (2016); Prepare for the rare – fast exchange of database entries for strengthening MALDI-TOF MS diagnostics on the example of Streptobacillus; 15. Medical Biodefense Conference, 26.–29.04.2016, Munich; Poster.

Rau J, Eisenberg T, Männig A, Wind C, Lasch P, Sting R (2016); MALDI-UP – An Internet Platform for the Exchange of MALDI-TOF Mass Spectra - User guide for http://maldi-up.ua-bw.de; Aspects of food control and animal health 01 2016, 1–17.

Rau J, Männig A, Hiller E, Mauder N, Wind C, Horlacher S, Kadlec K, Schwarz S, Contzen M (2016); MALDI-TOF mass spectrometry for reliable identification of bacteria – A validation based on Staphylococcaceae field isolates; Aspects of Food Control and Animal Health 03 2016, 1–46.

Wind C, Diekmann R, Helble S, Grabowski N, Scherer B (2016); Insekten als Lebensmittel / Identifikation mittels MALDI-TOF-MS. Amtstierärztlicher Dienst und Lebensmittelkontrolle, Sonderausgabe zur 57. Arbeitstagung des Arbeitsgebietes Lebensmittelhygiene der DVG: 27.9.–30.9.2016, Garmisch-Partenkirchen, Seite 215. Poster.

2015

Stoll P, Rau J (2015); Identification of animal species from meat using MALDI-TOF MS; 44. Deutscher Lebensmittelchemikertag 14.–16.09.2015 Karlsruhe; Poster (translated for Bruker Poster Hall 2016).

Stoll P, Rau J (2015); Tierartendifferenzierung von Fleisch mittels MALDI-TOF MS; 44. Deutscher Lebensmittelchemikertag 14.–16.09.2015 Karlsruhe; Posterpreis.

2014